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TD3B:用于变构配体生成的过渡导向离散扩散模型
AI 摘要
研究团队推出TD3B,一种基于序列的生成框架,专门设计具有指定激动剂或拮抗剂行为的蛋白质配体。该方法通过过渡导向控制目标,结合目标感知的方向预测器、软结合亲和力门控机制,并对预训练的离散扩散模型进行摊销微调。TD3B能够生成与结合亲和力解耦、且基于平衡或纯推理基线无法实现的定向配体,尤其针对临床相关的GPCRs,解决了现有基于静态结构的设计方法无法表征非可逆方向性效应的局限。代码与模型已开源。
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