基因组基础模型的进展因基准碎片化、评估协议不兼容而难以评估。GENEB是一个大规模诊断基准，在统一探针协议下评估40个模型在100个任务（13个功能类别）上的冻结表示，包含少样本场景。分析显示聚合排行榜不稳定：模型排名在不同任务类别间差异显著，规模带来的收益有限且不一致，架构和预训练对齐的影响常超过参数数量。GENEB为基因组机器学习提供了原则性比较和类别感知模型选择的参考框架。